王三元，男，清代武官。

正文

王三元为中国清朝武官官员，本籍西。行伍出身的王三元於1700年（康熙帝39年）奉旨接替陈国任，於台湾地区担任澎湖水师协副将。而隶属台湾镇之下的此官职职等为正二品，是台湾清治时期的这阶段，扼守台湾海峡的重要武将，并统帅两标水营，数千名北洋水师兵勇。

前任：

陈国任 澎湖水师协副将